Определение молекулярно-генетических подгрупп медуллобластомы на основании анализа уровня экспрессии генов

В основе клинической гетерогенности медуллобластом лежат различия, выявляемые на молекулярном уровне, в виде неодинакового профиля экспрессии генов, метилирования ДНК и мутационного спектра. Выявление данных различий послужило основанием для создания в 2016 году новой классификации опухолей центральной нервной системы, в которой предусмотрено разделение медуллобластом на молекулярно-генетические подгруппы. Принадлежность медуллобластомы к определенной молекулярно-генетической подгруппе определяет исход заболевания, ответ на проводимую терапию, вероятность развития рецидива и прогноз. В настоящей работе представлены результаты использования технологии NanoString для определения молекулярно-генетической подгруппы медуллобластом на 65 гистологических образцах.

медуллобластома, дети, молекулярно-генетические подгруппы, NanoString, прогноз

1. Coluccia D., Figuereido C., Isik S., Smith C., Rutka J.T. Medulloblastoma: Tumor Biology and Relevance to Treatment and Prognosis Paradigm. Curr Neurol Neurosci Rep 2016; 16 (5): 43-54.

2. Taylor M.D., Northcott P.A., Korshunov A., Remke M., Cho Y.J., Clifford S.C., et al. Molecular subgroups of medulloblastoma: the current consensus. Acta Neuropathol 2012; 123 (4): 465-72.

3. Louis D.N., Perry A., Reifenberger G., von Deimling A., Figarella-Branger D., Cavenee W.K., et al. The 2016 World Health Organization Classification of Tumors of the Central Nervous System: a summary. Acta Neuropathol 2016; 131 (6): 803-20.

4. Northcott P.A., Korshunov A., Pfister S.M., Taylor M.D. The clinical implications of medulloblastoma subgroups. Nat Rev Neurol 2012; 8 (6): 340-51.

5. Pietsch T., Schmidt R., Remke M., Korshunov A., Hovestadt V., Jones D.T., et al. Prognostic significance of clinical, histopathological, and molecular characteristics of medulloblastomas in the prospective HIT2000 multicenter clinical trial cohort. Acta Neuropathol 2014; 128 (1): 137-49.

6. Northcott P.A., Korshunov A., Witt H., Hielscher T., Eberhart C.G., Mack S., et al. Medulloblastoma comprises four distinct molecular variants. J Clin Oncol 2011; 29 (11): 1408-14.

7. Hovestadt V., Remke M., Kool M., Pietsch T., Northcott P.A., Fischer R., et al. Robust molecular subgrouping and copy-number profiling of medulloblastoma from small amounts of archival tumour material using high-density DNA methylation arrays. Acta Neuropathol 2013; 125 (6): 913-16.

8. Northcott P.A., Shih D.J., Remke M., Cho Y.J., Kool M., Hawkins C., et al. Rapid, reliable, and reproducible molecular sub-grouping of clinical medulloblastoma samples. Acta Neuropathol 2012; 123 (4): 615-26.

9. Geiss G.K., Bumgarner R.E., Birditt B., Dahl T., Dowidar N., Dunaway D.L., et al. Direct multiplexed measurement of gene expression with color-coded probe pairs. Nature Biotechnology 2008; 26: 317-25.

10. Gajjar A., Bowers D.C., Karajannis M.A., Leary S., Witt H., Gottardo N.G. Pediatric Brain Tumors: Innovative Genomic Information Is Transforming the Diagnostic and Clinical Landscape. J Clin Oncol 2015; 33 (27): 2986-98.

11. Shih D.J., Northcott P.A., Remke M., Korshunov A., Ramaswamy V., Kool M., et al. Cytogenetic prognostication within medulloblastoma subgroups. J Clin Oncol 2014; 32 (9): 886-96.

12. Pfister S., Remke M., Benner A., Mendrzyk F., Toedt G., Felsberg J., et al. Outcome prediction in pediatric medulloblastoma based on DNA copy-number aberrations of chromosomes 6q and 17q and the MYC and MYCN loci. J Clin Oncol 2009; 27 (10): 1627-36.

13. ЦаурГ.А., ДруйА.Е., ПоповА.М., СеменихинаЕ.Р., РигерТ.О., ИвановаА.С. идр. Возможность использования микроструйных биочипов для оценки качества и количества РНК у пациентов с онкологическими и онкогематологическими заболеваниями. Вест. уральской мед. академич. науки, 2011; 4: 107-11.

14. LiuM.C., PitcherB.N., MardisE.R., DaviesS.R., FriedmanP.N., SniderJ.E., etal. PAM50 gene signatures and breast cancer prognosis with adjuvant anthracycline- and taxane-based chemotherapy: correlative analysis of C9741 (Alliance). NPJ Breast Cancer 2016; 2: 15023.